新方法预测细菌耐药性基因准确率高

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  科技日报华盛顿10月12日电(记者刘海英)美国华盛顿州立大学研究人员开发出这俩预测细菌耐药性基因的新最好的土措施,通过机器学习和博弈论模型,亲戚其他同学能以93%—99%的准确率,预测3种不之类型革兰氏阴性菌中耐药基因的指在。

  细菌对抗菌素的耐药性已成为影响全球公共健康的重要大问题,威胁着亿万人群,仅美国每年全是数百万人会被耐药细菌感染,因为成千上万人死亡。近年来,科学家一个劲在努力寻找预测、识别抗菌素耐药性基因的手段,以求更有效地对病患施药。随着全基因组测序技术的突破,亲戚其他同学开发出序列比对最好的土措施,通过序列之类性来鉴定抗菌素耐药性基因,但遇到与已知抗菌素耐药性基因具有深度图之类性的序列时,有有哪些最好的土措施则一些无能为力。

  此次,华盛顿州立大学研究团队决定使用博弈论来帮助预测、识别抗菌素耐药性基因。博弈论是这俩研究具有斗争或竞争大问题的数学理论和最好的土措施,是当前经济学的标准分析工具之一。在博弈模型中,另另有一个参与者的行为会影响并取决于一些参与者的行为。

  研究团队使用其开发的机器学习算法和博弈论模型,不仅对细菌基因组中简单的序列之类性进行分析,还深入研究了蛋白质序列型态、理化型态、进化型态、组成型态等多个型态的相互作用,以求准确预测抗菌素耐药性基因。亲戚其他同学在9日的《科学报告》上发表研究论文称,使用新最好的土措施预测3种革兰氏阴性菌——假单胞菌、弧菌和肠杆菌的抗菌素耐药性基因序列,其准确度达到93%—99%。

  研究人员表示,这俩 新颖的博弈论最好的土措施有点强大,其将基因型态的相关性和相互依赖性综合考虑,根据它们在整体上协同工作的能力来识别之后的抗菌素耐药性基因,因而能能鉴定出之后通过简单序列比对最好的土措施无法识别的推定抗性基因。随着抗菌素耐药性的增长和现有测序基因组数量的增加,迫切时需开发新的、更准确的耐药基因预测、识别工具,而亲戚其他同学的研究表明,机器学习模型将是另另有一个重要研发方向。

[ 责编:肖春芳 ]

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